Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18L1O75177 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms