Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms