Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms