Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms