Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APAF1O14727 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APAF1O14727 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms