Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KPNA3O00505 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms