Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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