Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
A4D1N5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
A4D1N5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
A4D1N5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
A4D1N5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
A4D1N5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
A4D1N5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
A4D1N5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
A4D1N5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
A4D1N5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
A4D1N5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
A4D1N5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
A4D1N5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
A4D1N5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
A4D1N5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms