Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms