Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFR3BQ9Y2G0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms