Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms