Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms