Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFSF18Q9UNG2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms