Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VTI1BQ9UEU0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms