Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms