Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms