Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms