Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKIRAS1Q9NYS0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms