Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms