Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC31BQ9NQW1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC31BQ9NQW1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC31BQ9NQW1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC31BQ9NQW1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC31BQ9NQW1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC31BQ9NQW1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms