Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms