Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms