Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms