Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms