Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP8Q9BV40 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms