Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms