Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNN2Q99439 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNN2Q99439 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNN2Q99439 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNN2Q99439 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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