Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms