Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF607Q96SK3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms