Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOLD1Q96LR9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOLD1Q96LR9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms