Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms