Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFXN5Q8TD22 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms