Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms