Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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