Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP13Q86W25 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP13Q86W25 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms