Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SCXQ7RTU7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SCXQ7RTU7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SCXQ7RTU7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SCXQ7RTU7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SCXQ7RTU7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SCXQ7RTU7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SCXQ7RTU7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms