Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP47Q6ZTR5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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