Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00114Q6XXX2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms