Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC27Q6UX04 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC27Q6UX04 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms