Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF613Q6PF04 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms