Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3EQ6PEY2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3EQ6PEY2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms