Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP100Q494V2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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