Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms