Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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