Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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LAMA4Q16363 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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LAMA4Q16363 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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LAMA4Q16363 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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LAMA4Q16363 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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LAMA4Q16363 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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LAMA4Q16363 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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LAMA4Q16363 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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LAMA4Q16363 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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LAMA4Q16363 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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