Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CST6Q15828 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CST6Q15828 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CST6Q15828 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CST6Q15828 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms