Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSC22D1Q15714 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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