Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms