Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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