Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms